代谢网络建模

英文:Metabolic Network Modeling 分类:science

基本释义

用计算模型描述细胞代谢反应网络的数学方法,预测基因扰动、底物变化下的代谢流与产物。它是合成生物学与代谢工程的定量基础。

技术要点

核心工具是约束模型(COBRA:FBA 通量平衡分析、pFBA),以基因组注释重建代谢网络(GEM);AI 增强包括:机器学习学习代谢状态、大模型辅助网络重建与泛基因组扩展。模型预测需与实验(13C 代谢流、生长表型)对照。

应用场景

用于代谢工程菌株改造(氨基酸、天然产物高产)、疾病代谢机制(癌症代谢、遗传代谢病)研究与生物燃料设计;工业发酵优化中广泛使用。

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