英文:Protein Docking 分类:science
预测两个或多个蛋白(或蛋白与其他分子)结合后的三维复合物结构。对接揭示分子间识别机制,是理解信号通路、设计抗体的基础。
方法包括:物理采样+打分(ClusPro、ZDOCK)、深度学习(AlphaFold-Multimer、几何图网络、扩散生成复合物);需考虑构象变化与柔性。评价用 DockQ、界面 RMSD 与 CAPRI 标准;对复合物构象集合(ensemble)质量评估。
用于抗体-抗原结合模式研究、蛋白复合物结构解析辅助、突变效应分析与蛋白互作网络构建;与冷冻电镜、交联质谱实验数据结合提高可信度。
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