构象生成

英文:Conformation Generation 分类:science

基本释义

生成分子三维构象(原子空间排列)的技术。同一分子的不同构象决定其与蛋白结合与物化性质,构象生成是分子建模、对接与性质预测的前置步骤。

技术要点

传统方法(RDKit 距离几何、分子动力学采样)与 AI 方法(生成模型直接预测 3D 坐标,如 GeoDiff、Torsional Diffusion)并存;需生成多样且能量合理的构象集合(ensemble),并保证手性与价键约束。评价用 RMSD 与能量分布。

应用场景

用于分子对接前的构象准备、虚拟筛选的构象多样性、构效关系研究与力场参数化;在 CADD 与 AI 制药管线中是基础数据生成环节。

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