英文：Protein-Protein Interaction 分类：science
预测蛋白质之间的结合界面与亲和力，理解信号通路与疾病机制。蛋白互作是生命活动的枢纽，也是药物（如抗体）设计的靶标；AI 从序列与结构层面预测互作模式。
方法包括：对接与界面预测（AlphaFold-Multimer、系列几何模型）、基于序列的互作预测（图神经网络+进化信息）、结合亲和力排序；难点是构象变化（induced fit）与多聚体复杂性。评价基准如 Docking Benchmark、PPI 数据集。
用于抗体/纳米抗体设计、信号通路重建、药物副作用（脱靶互作）预测与蛋白质工程；与实验（SPR、共沉淀）验证结合，加速靶点发现与生物药研发。
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